デメリット

放射線を使うため被爆をします。しかし、この検査を受けることによって新たにがんが発生するという報告はありません。 また、胸部CT検査で異常が見つかったとしても、結果的に肺がんでないこともあります。
喫煙習慣のある人、喫煙習慣のあった人を対象として胸部CT検査を行うと、３～６割の人に何らかの異常な影が見つかる事が報告されています。この異常な影の9割以上は肺がんではありませんが、なかには肺がんと非常に紛らわしいものもあります。
そこで、肺がんか否かを診断するために、精密検査（針を刺して組織を取るなど）やしばらく期間をあけて胸部CT検査を再検するなど定期的な経過観察が必要になることがあります。この場合、実際には肺がんではないのに不安を抱える可能性や、胸部CTを受けなければ、行わなくて済んだ精密検査を受けることになってしまうような不利益を被る可能性があります。
さらに、肺がんが発見されても進行速度が遅いがんだった場合、放置してもすぐには命にかかわらないこともあり、長期の経過観察が必要となる事もあります。